Manuel fue detenido con violencia y sin orden de aprehensión el 26 de mayo del año 2000, en el poblado de Tepexpan, perteneciente a Acolman y fue acusado por el delito de homicidio sin pruebas ni testigos, por lo que fue ingresado a una penitenciaría del Estado de México, donde empezó a peregrinar de un penal a otro, de un juzgado a otro, hasta llegar con el Juez Tercero del penal de Toluca, y ahora Magistrado, Arturo Velázquez Méndez, quien lo sentenció a más de 40 años de prisión, el próximo 26 de mayo cumplirá 20 años en prisión.

Entre las irregularidades que es acusado Manuel, se encuentra que el peritaje del cadáver presentado era totalmente diferente al que la supuesta víctima:

. Con un color de piel diferente.

. Tres centímetros menos de estatura

. Sin señas particulares específicas, que los propios familiares había expuesto ante el Ministerio Público como lunares, cicatrices y otras cosas.

“Se comprobó que la persona que supuestamente mató mi esposo sigue con vida. Lo acusan de algo que no tiene sentido” denunció Itzel del Carmen, esposa de Manuel.